自“无敌怪兽”被打败后，天才威便受了很大的打击，助手洞洞幺无意间发，偶然寻回的能量石碎片有着十分惊人的威力！于是，为了寻回所有碎片激活能量石，天才威和洞洞幺谋划着新的“怪兽计划”。为了维护森林的和谐安宁和动物伙伴们的安全…

天才威发现了一颗能量石，他想利用能量石创造出一只称霸海陆空的无敌怪兽，震惊科学界。为了采集动物们的能力，狡猾的天才威制造出外形逼真的各式采集器迷惑动物们，夺取能力。为了森林的和谐和安宁，光头强、熊大、熊二联合小动物们一起…

天才威发现了一颗能量石，他想利用能量石创造出一只称霸海陆空的无敌怪兽，震惊科学界。为了采集动物们的能力，狡猾的天才威制造出外形逼真的各式采集器迷惑动物们，夺取能力。为了森林的和谐和安宁，光头强、熊大、熊二联合小动物们一起…

为了对抗天才威，保护动物和森林，导游光头强和熊大、熊二、赵琳再度团结，组成探险小队，上演一幕幕奇妙逗趣、惊险刺激、感人至深的全新探险故事。

《熊出没之探险日记2》则延续了上一季的剧情，除了保留大家最爱的女性角色赵琳外，还加入了人类大反派“天才威”等新角色，使剧集更具矛盾冲突。.