江户时代末期（本作的20年前），被称为天人（あまんと）的谜之异星人来袭。于是地球人与天人之间的战争瞬即爆发，为数众多的武士和攘夷派志士都参与与天人的战斗。幕府见识到天人强大的实力后，最终向天人低头，放弃武士不管，擅自与天人…

故事讲述居住在一个破旧公寓中的，虽然贫穷但却很快活的3个美少年大学生竹本、真山、森田面前出现了一位如同小姑娘般的新生花本はぐみ，面对花本はぐみが尚无感觉到自身恋情的竹本，和被牵扯进奇怪气氛中的森田，另一方面真山也尚为察觉…

他们用自己的智慧和热情反对“禁止巧克力法”，究竟能否回到那个自由，开心又“美味”的世界呢。。。